R 유명한 패키지 정리

유명하고 많이 사용하는 R 패키지 정리

가장 유명하고, 많이 다운로드 되는 R 패키지들을 그 목적에 따라서 정리하였습니다. 본 포스트는 이 포스트를 참고하였습니다.

데이터 로드

RMySQL, RPostgresSQL, RSQLite - 데이터 베이스로부터 직접 데이터를 읽을 때 사용하는 패키지들이다. R[데이터베이스명] RMySQL은 MySQL의 데이터들을 직접 R로 불러올 수 있다.

XLConnect, xlsx - 이 패키지들은 Microsoft사의 엑셀을 R로부터 직접 읽어올 수 있게 한다. 물론, write도 가능하다.

foreign - SAS, SPSS 데이터셋을 읽어올 때 사용한다. 예를 들어, SAS의 경우 sas7bdat 확장자로 되어있는 파일인데, 이를 읽어올 때 foreign 패키지를 활용할 수 있다.

일반적인 텍스트 파일을 로드할 때, R에서는 별다른 패키지가 필요하지 않다. read.csv, read.table, read.fwf를 이용하면 된다. 이외의 독특한 자신만의 데이터셋을 불러오고 싶다면 CRAN guide에 데이터 import, export에 관하여 문의할 수도 있다. 

데이터 핸들링

dplyr - 데이터 subsetting, summarizing, rearranging, joining에 대한 더 쉬운 길을 제공한다. dplyr는 빠른 데이터 핸들링을 위하여 반드시 사용하는 패키지이다.(go to package) 

tidyr - 데이터셋의 레이아웃을 바꿀 때 유용한 툴이다. 데이터를 tidy format으로 바꾸기 위해 gather이나 spread 함수를 사용할 수 있다.

stringr - 문자열 다루는 것과 정규 표현식 관련 패키지이다. 

lubridate - date와 time을 더욱 다루기 쉽게 만드는 툴이다.

데이터 시각화

ggplot2 - R의 매우 유명한 시각화 패키지이다. grammar of graphics 를 활용하여 layered, customizable plot을 만들 수 있다는 장점이 있다.

ggvis - grammar of graphics을 기반으로 동작하는, 대화형, 웹베이스의 그래픽 라이브러리이다.

rgl - Interactive 3D 시각화를 위한 라이브러리이다. 

htmlwidgets - 자바스크립트 기반의 interactive 시각화를 위한 툴이다. 이 패키지는 아래와 같은 htmlwidget들을 구현하고 있다.

• leaflet (maps)
• dygraphs (time series)
• DT (tables)
• diagrammeR (diagrams)
• network3D (network graphs)
• threeJS (3D scatterplots and globes)

googleVis - R에서 데이터 시각화를 위해 구글 차트를 이용할 수 있게한다. 구글 차트 툴은 Gapminder라고 불리기도 한다. 이는 시각화 소프트웨어로, Hans Rosling의 TED 출연으로 유명해졌다.

데이터 모델링

car - car 패키지의 Anova 함수는 type2, type3 아노바 테이블을 만드는데 유명하다.

mgcv - Generalized Additive Models

lme4/nlme - Linear, Non-linear 혼합효과모형

randomForest - 머신러닝의 랜덤 포레스트

multcomp - 다중비교를 위한 툴

vcd - 범주형 변수의 시각화와 분석을 위한 툴이다.

glmnet - Lasso, elastic-net 회귀분석을 cross validation과 함께 해준다.

survival - 생존분석

caret - 회귀분석 및 분류 모델의 트레이닝을 위한 툴이다.

데이터 리포트

shiny - 인터랙티브한 웹앱을 쉽게 만들어준다. 프로그래머가 아닌 일반 사람들에게 데이터 exploring과 sharing을 쉽게 만들어준다.

R Markdown - Reproducible reporting을 위한 툴이다. R 코드를  markdown 에 쓰고, render을 하면 R Markdown은 코드를 코드 실행 결과와 함께 HTML, pdf, word 형식으로 export를 해준다. 결과를 정리하는 다른 과정 없이 자동화된 리포팅을 알 수 있게 된다. R Markdown은 RStudio와 통합된다.

xtable - xtable 함수는 R Object(예를 들어, dataframe)를 통해 latex이나 HTML 코드로 리턴해준다. 이를 통해 문서에 붙여넣기를 쉽게할 수 있다. 

공간 데이터 

sp, maptools - shapefile을 비롯한 공간 데이터를 로딩할 수 있는 툴이다.

maps -  맵에 다각형을 쉽게 그려주는 툴이다.

ggmap -  Google map으로 부터 street map을 다운로드 받고, ggplot의 background로 쓸 수 있다.

시계열, 금융 데이터

zoo - 시계열 데이터를 저장하기 위한 가장 유명한 포맷을 다룰 수 있다.

xts - 시계열 데이터를 다루기 위한 툴

quantmod - 금융 데이터를 다운로드하고, 그래프를 그리고, 분석할 수 있는 툴이다.

높은 성능을 내기 위한 R 코드 작성

Rcpp - C++을 call하는 R function을 사용한다. 

data.table - 데이터셋을 빠르게 조작하기 위한 다른 방법을 사용한다. "빅 데이터"에 유용하다.

parallel - 큰 데이터 셋을 다루기 위한 병렬 프로세싱을 사용한다.

웹으로 작업하기

XML - R을 통해 XML 문서를 읽고 만드는 패키지

jsonlite - R을 통해 JSON 데이터를 읽고 만드는 패키지

httr - HTTP Connection을 통한 작업을 위한 라이브러리

R 패키지 만들기

devtools - 코드를 R 패키지로 만들기

testthat - 프로젝트의 유닛 테스트를 위한 쉬운 방법을 제공한다.

roxygen2 - R 패키지의 도큐먼트를 만들기 위한 빠른 방법. roxygen2는 코드의 코멘트를 도큐먼트로 만들고, 패키지의 네임스페이스를 만든다.