R studio server 에서 knitr 에러 발생시 해결 방법

R studio server 에서 knitr 에러 발생시 해결 방법

아래와 같은 오류 또는 test_env 를 찾을 수 없습니다. 등, Rmd 파일을 knitr 을 통해 변환시킬 때 에러가 발생했다. 

 

에러 메시지 예시

  |................................                                 |  50%
  ordinary text without R code

  |.................................................................| 100%


processing file: Preview-b0c112a265.Rmd
label: unnamed-chunk-1

Quitting from lines 16-26 (Preview-b0c112a265.Rmd) 
Error in file(file, "rt") : cannot open the connection
Calls: <Anonymous> ... withVisible -> eval -> eval -> read.csv -> read.table -> file
Execution halted

 

해결: [Tool] - [Global Options] - [R Markdown] - Evaluate Chunks in Directory 를 current 로 변경

 

위와 같이 세팅을 변경하자 문제가 해결되었다. 위 문제로 인해 마크다운 문서를 작성할 때 Rstudio server 가 아니라 로컬에서 작업을 항상 했었는데 불편함이 존재했었다. 위 방법으로 깔끔하게 해결되었고, 앞으로 마크다운 문서 작성도 R studio server 에서 하면 될듯하다.

 

참고 : https://stackoverflow.com/questions/26994958/error-cannot-open-the-connection-in-executing-knit-html-in-rstudio